Bundibugyo-virukseen ei ole tällä hetkellä saatavilla hyväksyttyjä rokotteita tai hoitoja, toisin kuin yleisempään ebolavirukseen.

Vaikka lääkettä ei ole, potilaiden oireita voidaan hoitaa. Potilaat voivat tarvita esimerkiksi kivunlievitystä, nesteytystä, tai kuumetta ja oksentelua hillitseviä lääkkeitä. Myös psykologisen tuen tarjoaminen sekä potilaille että läheisille on tärkeää.